現(xiàn)代社會人們對飲食的重視程度越高，對普通食品和飲料的質(zhì)量以及對新鮮食品的消費(fèi)的重視程度就越高。同時，另一個巨大的變化是盡量避免使用添加劑和防腐劑。經(jīng)過某些處理改變了正常微生物補(bǔ)充劑的食品尤其容易受到環(huán)境微生物侵蝕。例如，酸奶、奶酪等乳制品、果汁、調(diào)味奶及主菜。蘑菇生長有時在潔凈室進(jìn)行，以防止條件致病孢子的過度生長。

果汁
無菌產(chǎn)品占據(jù)了單一包裝（250毫升）果汁和飲料市場。市場正在擴(kuò)展到其他產(chǎn)品線，包括牛奶飲料、葡萄酒、水、番茄產(chǎn)品和一升包裝。

奶制品
無菌加工通常用于瑞士酸奶、無菌牛奶或奶酪以及瑞典香腸包裝。
一些大型設(shè)施需要超過100000級（ISO 8和9）。在美國，杰羅姆奶酪公司在愛達(dá)荷州杰羅姆建立了一家價值3600萬美元、140000平方英尺的奶酪和乳清工廠。該工廠有四個主要的加熱和通風(fēng)系統(tǒng)，每分鐘可輸送13萬立方英尺的空氣，過濾效率為95%，每小時通風(fēng)15至20次。車間采用正壓送風(fēng)。

無菌灌裝啤酒、果汁和蘇打水，添加了ISO 5級（100）和ISO 6級（1000）潔凈室。
在傳統(tǒng)系統(tǒng)中，采用隧道式巴氏殺菌法對產(chǎn)品進(jìn)行各種高溫處理，改變了產(chǎn)品的物理性能。相比之下，對無菌灌裝的低溫?zé)崽幚砜梢栽诙鄠€方面提高產(chǎn)品的質(zhì)量。
在啤酒中，香味和新鮮度等感官特性可以得到改善。它還可以提高大多數(shù)產(chǎn)品的穩(wěn)定性，延長貯存期。在果汁中使用時，避免了像管道巴氏殺菌法那樣長時間高溫處理，不會造成營養(yǎng)損失。結(jié)果表明，其香氣、口感、色澤等感官性狀得到改善。

肉類加工
美國聯(lián)邦農(nóng)業(yè)部的一項(xiàng)研究表明，美國近5%的即食肉制品感染了李斯特菌，這是一種致命的食物傳播疾病，可導(dǎo)致敗血癥、腦膜炎或腦膜腦炎，這是一種影響大腦和脊髓組織的疾病。對孕婦來說，李斯特菌可導(dǎo)致胚胎死亡和死胎。肉食市場的擴(kuò)大是提高潔凈室技術(shù)需求的一個因素。瑞典是這一領(lǐng)域的先驅(qū)。

面包店
面包店現(xiàn)在正逐漸采用無塵室技術(shù)。日本有很多這樣的例子。無塵車間凈化車間工廠生產(chǎn)各種面包、糖果、大豆豆腐、面條和幾種日本傳統(tǒng)食品。
糖果行業(yè)采用生物潔凈室技術(shù)。新的、更復(fù)雜的、包裝新穎的糖果產(chǎn)品增加了對受控環(huán)境（溫度、濕度、細(xì)菌水平等）和生產(chǎn)過程自動化的需求，以確保良好的質(zhì)量和耐用性。